Arge ve Tasarım Merkezlerinde yapılan harcamaların desteklenmesi ancak aktifleştirilmesi nedeniyle Kurumlar Vergisi Matrahında indirim olarak dikkate alınır. Aktifleştirilen tutarlar öncelikle 263 Araştırma Ve Geliştirme Giderleri hesaplarında takip edilir, proje bitti ve başarılı olduğu zaman ilgili hesaptaki tutarlar 260- Gayri

Maddi Haklar hesabına alınarak 5 yıl süreyle amortisman ayırmak suretiyle itfa edilecektir. 263 hesaba alınan tutarlar aynı zamanda ilgili yılda Arge İndirimi olarak Kurumlar Vergisinde indirim olarak dikkate alınacaktır. 

İlgili harcamaların detaylı kontrolü Ar-Ge indiriminin doğru hesaplanması için oldukça önemlidir. Projelerde çalışan personelin ücretlerinin ilgili projelere dağılımı, projede kullanılmak üzere alınan stokların ilk alındığında bu hesaba alınmaması kullanıldıkça ortaya çıkan maliyetin 263 hesaplara alınması, dışardan alınan danışmanlık bedellerinin Arge gideri toplamının %20’sini aşamayacağı, mali Müşavirlik giderlerinin bu kapsamda değerlendirilemeyeceği, seyehat giderlerinin telefon fax giderlerinin Arge indirimine konu edileceği şeklinde düzenlemelerin bu kapsamda incelenmesi yerinde olacaktır.

Diğer taraftan Tubitak’dan alınan teşvik ve hibelerin Kurumlar Vergisi üzerinde hesaplanan Arge İndirimi tutarından düşülmesi unutulmamalıdır. Bu kapsamda hibelerin ilgili yıla isabet eden ve henüz ödenmese bile ödenecek rakamında ihtiyatlılık ilkesi gereği hesaplanarak Arge İndiriminden düşülmesi gerekmektedir.
Kazancın yetersiz olması nedeniyle ilgili hesap döneminde indirim konusu yapılamayan Ar-Ge indirimi tutarı, 5746 sayılı Kanun çerçevesinde takip eden yıllara yeniden değerleme oranında endekslenerek devreder.

İlave Ar-Ge İndirimi

Bir sonraki yılda aşağıda belirtilen konularda ve oranda artış olması durumunda, o yıl yapılan Ar-Ge harcamalarının bir önceki yılı aşan tutarı %50 oranında artırılarak ekstra indirim konusu yapılabileceği belirtilmiştir.

• · Ar-Ge veya tasarım harcamasının toplam ciro içindeki payı
• · Tescil edilen ulusal veya uluslararası patent sayısı
• · Uluslararası destekli proje sayısı
• · Lisansüstü dereceli araştırmacı sayısının toplam Ar-Ge personeli sayısına oranı        %20 ARTIŞ
• · Toplam araştırmacı sayısının toplam Ar-Ge personeli sayısına oranı
• · Ar-Ge sonucu ortaya çıkan yeni ürünlerden elde edilen cironun toplam ciroya oranı